為確保全自動往復機的安全性及一切正常運作，系統保護有機械設備防滑保護、電氣設備限位保護、應急終止保護等。 當產生突發事件時，可按住應急終止按鍵，系統傳動系統一部分會馬上制動系統并停止運行。以較大 水平的保護機器設備及生命安全。全自動通常小復式噴漆機的電氣設備限位保護有雙層設計方案保護，各自為行程范疇保護和極限位置保護。當系統一切正常運作時，自動噴涂設備自始至終運作在行程范疇內，安裝在兩邊的行程限位接近傳感器和伺服電機內部部位數據信息對系統自始至終作出分辨和調整，確保其防止出現過行程出現異常；當操作錯誤或別的要素造成的部位過沖出現異常產生時，全自動往復式自動噴漆設備安裝在兩極限端限位接近傳感器檢知到過沖出現異常時，系統馬上采取行動，傳動系統馬上制動系統并應急終止系統，另外系統開啟常見故障警報。